O CTe complementar de Valores, deve ser utilizado em casos em que o Valor do CTe emitido foi menor do que o valor correto.
Neste caso será emitido um Novo CTe com os dados anteriores para então complementar o valor faltante.
Pontos de atenção no preenchimento do TXT:
Os campos referentes que serão representados seguem o Layout do Arquivo de Emissão do CTe : https://documentacao.nstecnologia.com.br/docs/ns-cte/manuais-de-integracao/layout-do-arquivo-de-emissao-ct-e/
O CT-e complementar deverá ser emitido com os mesmos dados do anteriores nos seguintes campos:
- Tomador,
- Remetente,
- Destinatário,
- CFOP
- NF-e vinculada,
- Valor da mercadoria
- Motorista.
O código da situação tributária (CST) também continua o mesmo, lembrando que se houver ICMS este deverá ser destacado proporcional ao novo valor do CT-e.
Natureza da operação:
Pode ser utilizada a Natureza CTe Complementar de Valor. Ou conforme orientação do Fisco. Onde será preenchido na coluna 4 do grupo B.
Tipo do CT-e:
A informação do Tipo do CT-e deve ser preenchido com o valor: 1 = CT-e de Complemento de Valores, Na coluna 14 do Grupo B.
Dados do Produto referentes ao grupo I do manual:
- Valor Total da Prestação do Serviço: Informar o valor a ser complementado (coluna 1 do Grupo I)
- Valor a Receber: Valor complementar (coluna 2 do Grupo I)
Obs: O Valor complementar é a diferença do valor total do CT-e para o valor total correto, ex: se o CT-e tiver sido emitido em R$ 500,00, e valor total correto for R$ 3.000,00; o Valor do CT-e complementar será R$ 2.500,00)
- Valor do componente: Informar o Peso 1.00 (coluna 2 do Grupo I02)
- Valor total da carga: Informar o Valor Complementar (coluna 1 do Grupo L)
- Produto predominante: Informar a Descrição “COMPLEMENTO DE VALOR” (coluna 2 do grupo L)
- Quantidade: Deverá ser informado a Quantidade 1.00 (coluna 3 do grupo L02)
Observações Gerais:
Preencher conforme o regulamento informando o motivo da Complementação do Valor
Detalhamento do CT-e complementado:
Deverá ser informada a Chave de Acesso do CTe anterior ao qual está se referindo este Complemento do Valor na Coluna 1 do Grupo V
Exemplo do arquivo txt no Layout do emissor NS CT-e de um CTe Complementar de Valor:

Link post no blog: https://nstecnologia.com.br/blog/emitir-um-cte-complementar-de-valores/